Die Arbeit mit den neuen Medien stützt sich in der Jan-Wellem-Schule auf drei Säulen: den computerunterstützten Unterricht, eine Grundqualifizierung im IT-Bereich und den verantwortungsvollen Umgang mit Medien (Medienkompetenz).

Im computerunterstützten Unterricht wird der Computer als Lernmittel eingesetzt. Mit Hilfe von Lernprogrammen, Textverarbeitungsprogrammen und Informationsangeboten aus dem Internet erarbeiten sich die Schüler selbstständig Unterrichtsinhalte und vertiefen diese. 

Zur Grundqualifizierung im IT-Bereich gehören eine sachgerechte Bedienung des Computers, Basiskenntnisse in Standard-Anwender-Programmen (Textverarbeitung, Tabellenkalkulation, Fotobearbeitung usw.), sowie die Nutzung des Internets.

Für viele Schüler stellt der Computer heutzutage nicht nur ein wichtiges Arbeitswerkzeug, sondern auch ein zentrales Medium der Freizeitgestaltung dar. Deshalb ist neben dem computerunterstützen Unterricht und der IT-Grundqualifizierung auch die Erziehung zum verantwortungsvollen Umgang  Ziel und Inhalt des Unterrichts. Mit den Schülern werden in diesem Rahmen zum Beispiel Kriterien zur Bewertung von Computerspielen und von Internetangeboten erarbeitet.